监督抽检食品不合格，支付的费用不是违法所得。下面我将从几个方面详细解释这一结论：
行为定性：
- 被抽检方向抽检方提供样品的行为，不属于《食品安全法》规定的经营不符合食品安全标准食品的行为。因为这一行为并非以营利为主要目的，而是基于法律规定的配合义务。被抽检方慑于法律的权威提供样品，其行为本质上是配合行政执法部门的监督检查，而非主动经营不合格食品。
权利义务关系：
- 抽检方与被抽检方之间缺乏关于所抽检产品必须符合食品安全标准的权利义务关系。抽检方购买的是样品的检验价值，而非其食品安全标准要求的健康营养价值。因此，无论样品是否符合食品安全标准，都不会对双方的正当权益产生影响。
主观意愿及危害后果：
- 抽检方购买的食品仅用于检验，不会产生食用的危害后果。同时，被抽检方在提供样品时并无主观故意，其行为是依法配合抽检，不存在违法的主观意愿。根据《行政处罚法》的相关规定，即便从其他层面有模糊认识，也应根据其没有主观过错、没有造成危害后果的事实，作出不应没收上述款项的判定。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第二十八条的规定，违法所得是指实施违法行为所取得的款项。而在本案例中，被抽检方提供样品的行为并非违法行为，因此所取得的款项不属于违法所得。
综上所述，监督抽检食品不合格时，支付的费用不应被视为违法所得。这一结论既符合法律的规定，也体现了法律的公平与正义。如果您在这方面还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。