小区南面窗户玻璃开油烟机孔是否合法，需根据具体情况分析。

首先，我们要明确的是，小区业主在对自己房屋进行改造时，必须遵守相关法律法规、小区规划以及业主公约的规定。针对开油烟机孔这一行为，我们可以从以下几个方面进行分析：

1. 法律法规层面：

   • 根据《住宅室内装饰装修管理办法》等相关规定，业主在进行室内装饰装修时，不得擅自变动房屋建筑主体和承重结构，不得擅自改变房屋外观和使用功能。开油烟机孔如果涉及到房屋结构的改动或可能影响房屋安全，那么就需要经过相关部门的批准。
   • 同时，业主也需要遵守当地城市规划、建筑管理等方面的法律法规，确保改造行为不违反相关规定。

2. 小区规划及业主公约层面：

   • 小区规划通常会对房屋外观、使用功能等方面做出规定，业主在改造房屋时需要遵守这些规定。
   • 业主公约是小区业主共同制定的行为规范，其中可能包含关于房屋改造、外观维护等方面的条款。业主在进行改造前，应查阅业主公约并确保自己的行为符合规定。

3. 实际操作层面：

   • 如果开油烟机孔不涉及房屋结构的改动，且符合小区规划和业主公约的规定，那么业主在征得物业公司同意后，可以进行改造。
   • 如果改造行为可能影响到其他业主的权益，如噪音、油烟排放等，业主还需要与其他业主进行协商，并确保改造行为不会对其他业主造成不良影响。

综上所述，小区南面窗户玻璃开油烟机孔是否合法，取决于改造行为是否遵守了相关法律法规、小区规划以及业主公约的规定。因此，在进行改造前，建议业主先咨询物业公司或相关部门，了解具体的规定和要求，并确保自己的行为符合规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。