损毁基本农田建设水池13平方米是违法的。针对这一问题，我将从以下几个方面进行详细解答：

一、法律依据

根据《中华人民共和国土地管理法》第三十五条：“永久基本农田经依法划定后，任何单位和个人不得擅自占用或者改变其用途。”同时，该法还规定了对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的行为，将依法进行处罚。因此，损毁基本农田建设水池，无论面积大小，都违反了土地管理法的规定。

二、违法后果

1. 行政处罚：相关部门将责令限期改正或治理，恢复原种植条件，并可能处以罚款。具体罚款数额会依据违法情节和当地的相关规定来确定。
2. 刑事责任：如果构成犯罪，如非法占用农用地罪，还将依法追究刑事责任。

三、处理方式

1. 主动恢复：如果违法行为尚未造成严重后果，建议立即停止违法行为，并主动恢复基本农田的原种植条件。
2. 接受处罚：如果已经造成损害，应主动向相关部门报告，接受行政处罚，并按要求整改。
3. 法律咨询：在处理过程中，如果遇到法律问题或需要进一步的法律帮助，可以向我咨询，我会提供专业的法律建议和支持。

四、预防建议

1. 增强法律意识：了解并遵守土地管理法规，不擅自改变基本农田的用途。
2. 合理规划：在进行建设前，应咨询相关部门，确保建设项目符合土地利用总体规划。
3. 及时咨询：如果遇到土地利用方面的疑问或问题，应及时向我咨询，避免违法风险。

综上所述，损毁基本农田建设水池是违法的，需要承担相应的法律责任。建议尽快采取措施恢复基本农田的原种植条件，并接受相关部门的处罚。如果有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。