针对“出现事故科室值班不在岗怎么处理”的问题，首先需明确的是，这涉及医疗管理和法律责任两个层面。以下是从这两个角度给出的详细解答：
医疗管理层面：
- 立即报告：一旦发现科室值班人员不在岗且发生事故，应立即向上级医疗机构管理部门或相关负责人报告，确保事故得到及时处理。
- 应急处理：根据事故的严重程度，启动相应的应急预案，包括但不限于紧急救治患者、保护现场、收集证据等。
- 内部调查：医疗机构应迅速组织内部调查，查明值班人员不在岗的原因，以及事故与不在岗之间的关联性。
- 管理整改：根据调查结果，对医疗机构的管理制度进行反思和整改，包括加强值班制度、提高医护人员责任意识等。
法律责任层面：
- 医疗事故责任：如果事故被认定为医疗事故，且值班人员的不在岗与事故有直接因果关系，那么值班人员及医疗机构可能需承担相应的医疗事故责任。
- 行政责任：医疗机构及值班人员可能因违反医疗管理法规而面临行政处罚，如警告、罚款、吊销执业证书等。
- 民事责任：如果事故导致患者受损，患者或其家属有权向医疗机构及值班人员提起民事诉讼，要求赔偿损失。
- 刑事责任：在极端情况下，如果事故构成犯罪（如玩忽职守罪），值班人员及医疗机构相关负责人可能需承担刑事责任。
综上所述，出现事故科室值班不在岗的情况时，应立即采取应急措施并报告相关部门，同时启动内部调查以查明原因并整改。在法律责任方面，需根据事故的性质和后果来判断可能承担的责任类型，并据此采取相应的应对措施。如有任何具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。