员工私用章收款抵扣工资通常是不合法的。以下是详细分析：

1. 私用公章的违法性：

   • 私用公章本身可能构成违法违规，因为公章是公司的重要财物，代表着公司的法人意志，应由公司授权的人员在规定的范围内使用。

2. 扣工资的合法性：

   • 单位不能随意以员工私用公章这一行为来扣减其工资。工资是员工提供劳动后应得的报酬，受法律保护。
   • 除非员工的私用公章行为给单位造成了实际的经济损失，且单位能够证明该损失与私用公章行为之间存在直接的因果关系，并且单位已经按照合法的程序进行了调查和核算，才可以在合理的范围内扣除相应的工资作为赔偿。

3. 员工的权益保护：

   • 如果单位不能满足上述条件，单纯以私用公章为由扣工资，就是不合法的行为。
   • 员工有权维护自己的合法权益，可以通过与单位协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等方式来争取自己的权益。

综上所述，员工私用章收款抵扣工资通常是不合法的。单位不能随意以此为由扣减员工的工资，除非满足特定的条件。如果员工遇到此类情况，应及时咨询专业律师或相关机构，以维护自己的合法权益。如果你有其他劳动纠纷或法律问题，可以直接向我提问。