在税务部门上班同时持有残疾证，一般并不会直接带来后患，但可能涉及一些特定的法律权益和税务处理事项。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律权益保护

1. 残疾人就业保障：根据《中华人民共和国残疾人保障法》和相关政策，国家鼓励和支持残疾人就业，税务部门作为国家机关，有义务为残疾人提供平等的就业机会和必要的劳动条件。
2. 避免歧视：持有残疾证在税务部门工作，应享受与其他员工同等的待遇，不得因残疾而受到歧视或不平等待遇。

二. 税务处理事项

1. 个人所得税减免：根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，残疾人可能享受一定的个人所得税减免政策。具体减免额度和条件需根据当地税务部门的规定和个人的具体情况来确定。
2. 残疾人就业保障金：用人单位（包括税务部门）安排残疾人就业未达到规定比例的，需要缴纳残疾人就业保障金。但这一费用是由单位承担，与个人持有残疾证在税务部门工作无直接关联。

三. 可能的后患及应对

1. 工作适应性问题：虽然法律保障残疾人的就业权益，但实际工作中可能面临一些适应性挑战，如工作环境、工作任务等。建议与单位沟通，寻求合理的调整和支持。
2. 误解和偏见：尽管法律禁止歧视，但社会中仍存在对残疾人的误解和偏见。建议通过积极的工作表现和沟通，消除同事的误解，建立良好的工作关系。

我建议，作为持有残疾证在税务部门工作的员工，应了解自己的法律权益和税务处理事项，积极与单位沟通，争取合理的支持和调整。同时，保持积极的工作态度和良好的沟通技巧，以消除可能的误解和偏见。如有进一步需要，您可以继续咨询我。