登记机关以申请人签名不实为由拒绝登记申请是合规的。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 签名真实性的重要性

1. 法律要求：根据相关法律法规，申请人在进行登记时，必须提供真实、准确的信息，并签署真实姓名。这是确保登记信息真实性和有效性的基础。
2. 签名的作用：签名是申请人对登记内容真实性和准确性的确认，也是登记机关审核申请人身份和意愿的重要依据。

二. 签名不实的影响

1. 违反法律规定：如果申请人提供的签名不实，将直接违反相关法律法规对真实性和准确性的要求。
2. 损害登记制度的公信力：签名不实可能导致登记信息的不准确，进而损害登记制度的公信力和权威性。

三. 登记机关的拒绝权

1. 法律依据：根据相关法律法规，登记机关有权对申请人的登记申请进行审核。如果发现签名不实，登记机关有权拒绝登记申请。
2. 合规性：因此，登记机关以申请人签名不实为由拒绝登记申请，是依法行使审核权，符合法律法规的规定。

四. 实际案例

• 例如，在某房产登记案例中，申请人因提供虚假签名被登记机关拒绝登记。后经查实，该签名确实为伪造，登记机关的拒绝决定得到了法律的支持。

综上所述，登记机关以申请人签名不实为由拒绝登记申请是合规的。这一决定不仅符合法律法规的要求，也是维护登记制度公信力和权威性的必要措施。我建议申请人在进行登记时，务必提供真实、准确的信息，并签署真实姓名，以避免不必要的麻烦。如有进一步需要，您可以继续咨询我。