农民工在厂受工伤后，可以按照以下步骤进行处理：

一、紧急处理与证据保留

1. 紧急救治：首先，确保受伤农民工得到及时的医疗救治。如果情况紧急，可以先到就近的医疗机构进行抢救，待病情稳定后，再转入指定的工伤定点医疗机构。
2. 证据保留：对工伤现场和受伤情况进行拍照或录像，以保留证据。如果有监控设备，应确保及时保留现场监控视频。

二、工伤认定申请

1. 了解工伤认定条件：根据相关规定，即使农民工是受雇于包工头，与建筑公司没有直接联系，但在一定条件下（如建筑公司违法转包、分包给不具备用工主体资格的组织或个人），建筑公司仍需承担工伤保险责任。因此，农民工在工地受伤是可以申请工伤认定的。
2. 准备申请材料：个人申请工伤认定需要准备一系列材料，包括工伤认定申请表（需申请人签字按手印）、证人证言（需手书、签字按手印，并写明证人所在单位、职务、联系方式）、医疗诊断证明等。这些材料应使用A4纸提交，并确保所有复印件都加盖用人单位公章。
3. 提交申请：将准备好的申请材料提交给当地劳动保障行政部门。如果用人单位已参加工伤保险，则由其向劳动保障行政部门提出工伤认定申请；如果用人单位未参加工伤保险，农民工或其近亲属可以在事故发生一年内直接向劳动保障行政部门提出工伤认定申请。

三、劳动能力鉴定与赔偿

1. 劳动能力鉴定：在收到工伤认定结论后，如需申请确认停工留薪期及伤残等级鉴定，应按照当地规定下载并填写相关材料，并提交给劳动保障行政部门或指定的鉴定机构。
2. 赔偿处理：一旦工伤被认定，用人单位需按照《工伤保险条例》及当地规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用。这包括医疗费、护理费、交通费、住院伙食补助费、辅助器具费、停工留薪期工资等。如果造成残疾或死亡，还需支付一次性伤残补助金、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金以及丧葬补助金、供养亲属抚恤金和一次性工亡补助金等。

四、异地受伤处理

如果农民工在异地受伤，应在生产经营地进行工伤认定和劳动能力鉴定。用人单位在注册地和生产经营地均未参加工伤保险的，需按照生产经营地的规定依法由用人单位支付工伤保险待遇。

五、注意事项

1. 及时申请：工伤认定和赔偿有一定的时效限制，因此务必在规定的时限内提出申请。
2. 保留证据：在整个过程中，都要注意保留好相关证据和文件，以便在需要时提供证明。
3. 咨询专业人士：如果遇到复杂或难以处理的问题，建议咨询专业的劳动法律师或劳动保障部门的工作人员，以获取更详细的指导和帮助。