针对“铁路未签订安全协议违规施工怎么处罚”的问题，我们可以从相关的法规和实际案例来详细解答。

首先，根据《铁路安全管理条例》的相关规定，任何单位或个人在铁路线路安全保护区内进行施工，必须征得铁路运输企业的同意并签订安全协议。这是为了保障铁路运输的安全，防止因施工活动对铁路设施造成损害或影响铁路的正常运行。

如果未征得铁路运输企业同意并签订安全协议就擅自在铁路线路安全保护区内进行施工，那么这种行为将被视为违反了《铁路安全管理条例》的相关规定。对于此类违规行为，相关监管部门将依法进行处罚。

具体处罚措施方面，以广州铁路监督管理局对中国电建集团贵州工程有限公司的处罚为例。该公司因未签订安全协议擅自在南昆铁路线路安全保护区内铺设高压电缆下穿铁路线路，影响了铁路运输安全。广州铁路监督管理局根据《铁路安全管理条例》第八十九条第一款和《违反<铁路安全管理条例>行政处罚实施办法》第二十五条第一款第一项以及《国家铁路局铁路行政处罚裁量权基准》的相关规定，责令该公司改正违法行为，并处以4万元的罚款。

综上所述，对于铁路未签订安全协议违规施工的行为，相关监管部门将依法进行处罚，包括但不限于责令改正违法行为、处以罚款等。因此，建议所有在铁路线路安全保护区内进行施工的单位或个人，务必遵守相关法律法规，征得铁路运输企业的同意并签订安全协议，确保施工活动不影响铁路运输的安全。