将厂区宿舍楼改成公寓是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的详细分析：
土地用途角度：
- 如果厂区宿舍楼所在土地为工业用途，且未经规划部门批准擅自改变用途改作公寓，这通常是不合法的。因为土地用途的改变需要经过相关部门的审批，并符合城市规划和土地使用规划的要求。
- 如果厂区宿舍楼所在土地的规划允许部分或全部用于居住用途，并且已经过相关审批手续，如办理建设工程规划许可证等，那么在符合消防安全、建筑质量等要求的前提下，将其改作公寓则可能是合法的。
建筑安全与消防要求：
- 无论土地用途是否允许，将宿舍楼改成公寓都需要满足建筑安全和消防要求。这包括建筑结构的安全性、消防设施的完善性、疏散通道的畅通性等。如果无法满足这些要求，那么改造行为将是不合法的。
环保与物业管理规定：
- 改造过程中还需要考虑是否符合环保要求，比如是否会产生噪音、污染等。同时，也需要符合物业管理方面的规定，比如是否征得了其他业主的同意，是否违反了物业管理合同等。
法律后果：
- 如果未经批准擅自将厂区宿舍楼改成公寓，可能会面临行政处罚、责令恢复原状、赔偿损失等法律后果。因此，在进行改造前，务必咨询相关部门并办理相关手续。
综上所述，将厂区宿舍楼改成公寓的合法性取决于多个因素，包括土地用途、建筑安全与消防要求、环保与物业管理规定等。建议在进行改造前，充分了解相关法律法规和政策要求，并咨询相关部门以获取准确的指导和帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的咨询，请直接向我提问。