当您通过冠字号码查询确认所持有的为假币，并已经由银行业金融机构收缴后，关于假币收缴凭证的处理，您可以参考以下流程和建议：

首先，银行业金融机构在收缴假币时，会向您出具一式二份的假币收缴凭证。这份凭证是收缴单位和被收缴人（即您）各持一份的，作为收缴假币的官方证明。在凭证上，会详细记录被收缴假币的币种、版别、券别以及冠字号码等信息。如果收缴的假币有重号或连号的情况，这些信息会被填写在同一栏内。同时，收缴单位会在假币收缴凭证的盖章处加盖其业务公章，以确保凭证的真实性和有效性。

接下来，您应该妥善保管好自己持有的这份假币收缴凭证。它不仅是您被收缴假币的证明，也是您后续可能进行假币鉴定或申诉的重要依据。如果您对收缴的假币真伪存在异议，可以凭借这份凭证向鉴定单位申请鉴定。

如果您决定申请鉴定，需要填写货币真伪鉴定申请书，并提交给鉴定单位。鉴定单位在收到申请后，会进行专业的货币真伪鉴定，并出具货币真伪鉴定书。如果被鉴定为真币，您有权要求收缴单位退还；如果被鉴定为假币，则鉴定书将作为进一步的法律证据。

最后，需要强调的是，假币是违法的，持有和使用假币都会受到法律的制裁。因此，建议您在日常生活中提高警惕，注意识别假币，避免不必要的损失和法律风险。

总之，当您确认持有假币并被收缴后，务必妥善保管好假币收缴凭证，并了解相关的鉴定和申诉流程。如有任何疑问或需要进一步帮助，请及时咨询当地的银行业金融机构或相关部门。