在这种情况下，既然对方同意私了，并且修车费用已经确定为1000元，你可以按照以下步骤来处理：

1. 明确协议内容：首先，建议你们双方签订一个书面协议，明确剐蹭事故的责任划分、赔偿金额（即1000元）、支付方式以及支付时间等关键信息。这样做可以确保双方的权益得到保障，避免后续出现纠纷。

2. 保留证据：在签订协议之前，确保你收集了所有与事故相关的证据，如事故现场照片、双方车辆的损坏情况照片、以及可能的目击者证言等。这些证据将有助于证明事故的真实性和责任划分，为后续的协商或可能的法律程序提供支持。

3. 支付赔偿：根据协议约定的支付方式和时间，及时支付1000元赔偿款给对方。如果双方同意，也可以通过电子支付等便捷方式进行转账，并保留好转账记录作为支付凭证。

4. 后续跟进：在支付赔偿后，建议你们双方保持一段时间的联系，以确保没有其他未尽事宜或后续问题。如果出现任何争议或疑问，可以及时沟通解决。

总之，私了虽然是一种快速解决纠纷的方式，但也需要谨慎处理，确保双方的权益得到妥善保护。如果你在处理过程中遇到任何法律问题或疑虑，可以随时向我咨询。