指标房转让协议的有效性需根据具体情况判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 有效情形：

   • 若指标房符合相关政策规定，且转让行为经过了合法程序，特别是得到了售房单位的同意，那么转让方与受让方之间的房屋指标转让行为就是有效的。此时，指标房转让协议对双方具有法律约束力。
   • 转让协议的内容必须合法，不能违反国家法律法规的强制性规定，也不能违背社会公共道德和善良风俗。
   • 双方签订转让协议时，必须具备完全民事行为能力，且意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。

2. 无效情形：

   • 如果指标房本身存在限制转让的规定，如违反限购政策、未满足特定条件等，那么该转让协议通常无效。
   • 若转让协议的签订过程存在欺诈、胁迫等违法情形，协议也可能无效。
   • 如果转让方与售房单位的《购房合同》不能顺利履行，则转让方与受让方的转让协议也不具备条件而无效。

3. 附条件生效：

   • 在很多情况下，指标房转让协议是一个“附条件生效合同”。即转让方与受让方之间的转让协议在转让方与售房单位的《购房合同》顺利履行，转让方按约定获得标的房屋产权后，才具备转让条件并生效。

4. 法律建议：

   • 在签订指标房转让协议前，双方应充分了解相关法律法规和政策规定，确保转让行为合法有效。
   • 建议采用书面形式签订转让协议，并明确约定双方的权利义务、转让条件、违约责任等条款。
   • 如遇纠纷，应及时咨询专业律师，寻求法律帮助。

综上所述，指标房转让协议的有效性需结合具体情况进行综合判断。在签订协议前，双方应谨慎考虑并咨询专业意见，以确保自身权益得到保障。