产假期间申请仲裁，公司仍需支付产假工资。下面对此进行详细分析：

一. 产假工资的法律规定

1. 根据《劳动法》和《女职工劳动保护特别规定》，女职工在产假期间，享受与在岗期间相同的工资待遇，即产假工资。
2. 产假工资是女职工在产假期间应得的合法权益，不受其他劳动纠纷或仲裁程序的影响。

二. 仲裁期间产假工资的处理

1. 工资支付不受影响：女职工在产假期间申请仲裁，是为了解决与公司之间的其他劳动纠纷，但这并不影响其产假工资的支付。公司不能因女职工申请仲裁而停发或减发其产假工资。
2. 仲裁裁决的独立性：仲裁机构在裁决劳动纠纷时，会针对具体的纠纷事项进行裁决，而产假工资作为女职工的合法权益，通常不会成为仲裁裁决的直接内容。即使仲裁裁决对公司不利，公司仍需按照法律规定支付产假工资。

三. 实际案例

• 例如，某女职工在产假期间与公司发生劳动纠纷，并申请了劳动仲裁。在仲裁期间，公司仍需按照法律规定支付该女职工的产假工资，不得因其申请仲裁而有所扣减。

综上所述，女职工在产假期间申请仲裁，公司仍需按照法律规定支付其产假工资。这是女职工的合法权益，不受仲裁程序的影响。如有进一步需要，您可以继续咨询我。