首先，安全员扣押材料不交工伤科是不合法的行为，可能影响到工伤的认定和员工的合法权益。针对这一情况，你可以采取以下措施：

1. 明确沟通：

   • 与安全员进行直接沟通，了解其扣押材料的具体原因，向其说明提交材料对工伤认定的重要性，以及不提交可能带来的法律后果。
   • 如果安全员拒绝交出材料，可以要求其提供书面说明，并保留好相关证据。

2. 向管理层反映：

   • 如果与安全员的沟通无果，可以向工地的项目经理或更高层的管理人员反映情况，请求他们介入协调。
   • 强调工伤认定的紧迫性和重要性，以及材料被扣押可能对员工和公司造成的负面影响。

3. 寻求法律援助：

   • 如果公司内部无法解决问题，可以寻求专业法律援助，比如向我这样的律师咨询。
   • 律师可以根据具体情况，提供法律建议，甚至代表你与公司或安全员进行协商，以维护你的合法权益。

4. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果以上措施均未能解决问题，可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理。
   • 劳动监察部门有权力对违反劳动法规的行为进行查处，包括扣押工伤认定材料的行为。

5. 法律途径：

   • 在极端情况下，如果员工的合法权益受到严重侵害，可以考虑通过法律途径维护自己的权益，比如提起民事诉讼或行政诉讼。

在处理这一问题的过程中，建议你始终保持冷静和理性，避免采取过激行为。同时，保留好所有与工伤相关的证据和材料，以便在需要时提供证明。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。