邻居占用水沟建房是违法的。具体分析如下：

1. 相邻权保护：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第二百九十条，不动产权利人应当为相邻权利人用水、排水提供必要的便利。水沟作为排水设施，是相邻不动产之间排水的重要通道。
   • 邻居占用水沟建房，无疑会阻碍水的自然流向，影响其他相邻权利人的正常排水和生活，因此侵犯了相邻权。

2. 法律后果：

   • 受影响的相邻权利人有权要求邻居停止侵害、排除妨碍、恢复原状，即拆除占用水沟的建筑物，恢复水沟的正常排水功能。
   • 若因邻居的违法行为导致其他相邻权利人遭受损失，如房屋被水浸泡等，受影响的相邻权利人还有权要求邻居赔偿损失。

3. 建议：

   • 在发现邻居占用水沟建房时，应及时与邻居进行沟通，要求其停止违法行为，恢复水沟的正常使用。
   • 若沟通无果，可以向当地村委会或相关政府部门反映情况，寻求帮助和支持。
   • 必要时，也可以向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，邻居占用水沟建房是违法的，侵犯了相邻权利人的合法权益。受影响的相邻权利人可以采取相应的法律措施来维护自己的权益。