县级部门在一般情况下没有权利擅自更改基本农田。基本农田的变更是一个严格受法律监管的过程，必须遵循《中华人民共和国土地管理法》、《基本农田保护条例》等法律法规的规定，按照法定的程序和条件进行。
可以变更的情形
根据相关法律法规，基本农田在特定情形下可以依法进行变更：
- 国家重点项目需求：如国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目选址确实无法避开基本农田保护区，且经过严格的审批和论证后，可以对基本农田进行调整。
- 大型基础设施建设项目：经国务院批准的大型基础设施建设项目，在符合相关规划和审批要求的前提下，可对基本农田进行相应的调整。
变更的主要步骤
基本农田的变更需经过以下主要步骤：
- 申请与审查：相关单位或个人需向当地县级以上人民政府提出变更申请，并提交详细的变更方案和相关材料。政府将组织相关部门对申请进行初审。
- 规划调整方案编制与听证公示：由县级以上人民政府土地行政主管部门会同农业行政主管部门编制基本农田保护规划调整方案，并组织听证会，听取利害关系人的意见，对变更方案进行公示。
- 审批与备案：编制完成的基本农田保护规划调整方案需逐级上报，经省、自治区、直辖市人民政府批准后，报国务院备案。涉及占用基本农田面积较大或对农业生产和生态环境有重大影响的调整方案，还需直接报国务院审批。
- 公告与实施：调整方案经批准后，县级以上人民政府应及时发布公告，并组织实施基本农田的变更工作。
注意事项
在基本农田变更过程中，需注意以下几点：
- 补充划定基本农田：调整后应补充划定数量和质量相当的基本农田，确保本行政区域内基本农田总面积不减少。
- 生态环境保护：变更过程中要充分考虑生态环境保护要求，避免破坏生态环境。
- 土地使用权转移手续：变更涉及土地性质转变和土地使用权转移的，需依法办理相关手续。
综上所述，县级部门在更改基本农田时，必须严格遵守法律法规，按照法定程序和条件进行。如有任何关于基本农田变更的疑问或需求，请直接向我咨询，我将为您提供专业的法律建议和服务。