对于工程专业分包企业的违法行为，处理方式主要遵循相关法律法规，并确保处罚措施既具有威慑力又符合法规要求。以下是针对此类违法行为的详细处理流程及相关建议：
一、处理流程
调查与取证：
- 建设行政主管部门或其他有关部门在接到举报或发现违法分包行为后，将启动调查程序。
- 调查过程中，会收集相关证据，包括合同文件、支付记录、施工现场记录等，以确认违法分包的事实。
责令改正与没收违法所得：
- 一旦确认存在违法分包行为，行政主管部门将首先责令企业立即改正违法行为。
- 同时，会没收企业因违法分包所获得的全部违法所得。
罚款与行政处罚：
- 根据违法行为的严重程度，行政主管部门将对企业处以相应的罚款。
- 罚款数额通常根据违法所得的多少、违法行为的性质及影响等因素确定。
- 除了罚款，还可能对企业进行其他行政处罚，如责令停业整顿、降低资质等级等。
吊销资质证书：
- 对于情节特别严重的违法分包行为，行政主管部门将吊销企业的资质证书。
- 这意味着企业将失去从事相关工程业务的资格，对其市场声誉和业务发展造成严重影响。
连带赔偿责任：
- 如果违法分包导致工程质量不符合规定标准，造成损失的，违法分包企业与承包单位需共同承担连带赔偿责任。
- 这有助于保护受害者的合法权益，促进工程质量的提升。
二、相关建议
加强监管与执法力度：
- 行政主管部门应加强对工程分包市场的监管，定期进行检查和审计。
- 对于发现的违法行为，应依法严惩，形成有效的威慑力。
完善法律法规体系：
- 不断完善相关法律法规，明确违法分包的定义、处罚标准和程序。
- 为行政主管部门提供明确的法律依据，确保执法的公正性和合法性。
加强企业自律与诚信建设：
- 企业应自觉遵守法律法规，不进行违法分包行为。
- 加强企业诚信建设，提高市场信誉和竞争力。
加强宣传与教育：
- 通过多种渠道宣传法律法规和违法分包的危害。
- 提高企业和从业人员对违法分包行为的认识和警惕性。
综上所述，对于工程专业分包企业的违法行为，行政主管部门将依法进行严厉处理。同时，也需要加强监管、完善法律法规、加强企业自律和诚信建设以及加强宣传与教育等多方面的努力，共同维护工程分包市场的秩序和健康发展。