考上公务员后，用人单位不能以高中档案缺失为由辞退员工。以下是对此结论的详细解释：

1. 劳动合同关系与档案关系独立：

   • 考上公务员后，员工与用人单位之间建立的是劳动合同关系，这种关系主要基于双方签订的劳动合同以及相关的法律法规。
   • 高中档案是员工个人学历和经历的一部分，但它并不直接决定或影响劳动合同关系的存续。

2. 辞退员工的法定条件：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，用人单位辞退员工需要符合法定的条件和程序。
   • 高中档案缺失并不属于法定的辞退条件，因此用人单位不能以此为由单方面解除劳动合同。

3. 档案缺失的处理方式：

   • 如果员工的高中档案确实缺失，用人单位可以要求员工提供其他相关证明材料，如学历证书、学位证书等，以证实员工的学历和经历。
   • 在某些情况下，用人单位也可以与员工协商，通过其他方式补全或替代缺失的档案材料。

4. 法律建议：

   • 如果用人单位以高中档案缺失为由试图辞退你，你可以向用人单位提出质疑，并要求其提供合法的辞退依据。
   • 如果双方无法协商解决，你可以向当地的劳动监察部门或劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

综上所述，考上公务员后，用人单位不能以高中档案缺失为由辞退员工。如果面临此类问题，建议员工积极与用人单位沟通，并寻求法律途径维护自己的权益。