在处理甲方乙方工程款纠纷时，我们可以从以下几个方面来着手解决：

1. 明确合同条款：

   • 首先，应详细审查甲乙双方签订的工程合同，特别是关于工程款支付、工程质量、工期、违约责任等关键条款。
   • 如果合同中有明确约定工程款支付的时间、方式及违约责任，那么应严格按照合同约定执行。

2. 沟通协商：

   • 在发现工程款纠纷后，双方应首先进行友好沟通，尝试通过协商的方式解决分歧。
   • 可以邀请第三方（如工程监理、行业协会等）参与调解，以促进双方达成和解。

3. 法律途径：

   • 如果协商无果，甲方或乙方可以考虑通过法律途径解决纠纷。
   • 具体方式包括：向法院提起诉讼，要求对方按照合同约定支付工程款；或者申请仲裁，根据仲裁协议或仲裁条款将纠纷提交给仲裁机构进行裁决。

4. 收集证据：

   • 在采取法律途径之前，务必收集好相关证据，如合同文本、施工记录、付款凭证、往来函件等。
   • 这些证据将有助于证明自己的主张，并在诉讼或仲裁过程中发挥重要作用。

5. 注意时效：

   • 在处理工程款纠纷时，还应注意诉讼时效的问题。
   • 根据相关法律规定，如果未在规定的诉讼时效期间内提起诉讼或申请仲裁，可能会丧失胜诉权。

综上所述，处理甲方乙方工程款纠纷需要综合考虑合同条款、沟通协商、法律途径、证据收集以及时效等多个方面。如果您在具体操作过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。