担保期限约定为三年，三年后是否有效，需具体情况具体分析。
有约定且合法的情况：
- 如果担保合同中明确约定了担保期限为三年，并且这一约定不违反法律的强制性规定，那么在这约定的三年时间里，担保是有效的。债权人有权在担保期限内要求担保人承担担保责任。
约定不明或未约定的情况：
- 如果担保合同未约定担保期限，或者约定不明确，根据法律规定，一般保证和连带责任保证的保证期间为主债务履行期限届满之日起六个月。在这种情况下，如果债权人未在主债务履行期限届满之日起六个月内要求担保人承担责任，则担保责任免除。
特殊约定与法律规定：
- 需要注意的是，即使担保合同中约定了担保期限，但如果该约定违反了法律的强制性规定，如约定过短导致债权人无法合理行使权利，或约定过长而显失公平，那么该约定可能会被法院认定为无效。
- 此外，如果担保合同中存在其他违法或违规的条款，也可能影响担保的效力。
实际操作建议：
- 在签订担保合同时，应明确约定担保期限，并确保该约定符合法律规定。
- 如果担保期限已经届满，且债权人未在此期间内要求担保人承担责任，那么担保责任将自动免除。
- 如果存在争议，建议及时咨询专业律师，以获取针对具体情况的法律意见和分析。
综上所述，担保期限约定为三年，三年后是否有效取决于担保合同的具体约定以及法律规定。在签订和履行担保合同时，应严格遵守法律规定，并确保合同条款的合法性和有效性。