结论前置：法院以继父的兄弟不同意继女身份为由不受理继女宣告死亡的申请，这一做法在合法性上存在问题。

分析说明：

1. 宣告死亡的主体与条件：

   • 宣告死亡是自然人离开自己的住所，下落不明达到法定期限，经利害关系人申请，由人民法院宣告其死亡的法律制度。
   • 利害关系人包括被申请宣告死亡人的近亲属以及其他与被申请人有民事权利义务关系的人。

2. 继女作为利害关系人的资格：

   • 继女作为继父的家庭成员，与继父存在法律上的利害关系，特别是涉及继承等财产关系时。
   • 继父的兄弟对继女身份的质疑，不影响继女作为利害关系人提出宣告死亡申请的资格。

3. 法院受理的标准：

   • 法院在受理宣告死亡申请时，应审查申请人是否具备利害关系人资格，以及申请是否符合法律规定的条件。
   • 继父的兄弟对继女身份的异议，不是法院拒绝受理的合法理由。法院应依法审查申请本身是否符合条件，而非依据第三人的主观意见。

4. 法律程序与救济：

   • 如果法院以不合法的理由拒绝受理申请，申请人有权向上级法院申诉或寻求其他法律救济途径。
   • 在此情况下，继女可以依法向上级法院反映情况，要求纠正错误做法。

综上所述，法院以继父的兄弟不同意继女身份为由不受理继女宣告死亡的申请，这一做法缺乏法律依据。继女作为利害关系人，有权依法提出宣告死亡申请，法院应依法进行审查并作出决定。如果遇到类似问题，建议咨询专业律师以维护自己的合法权益。