针对您提出的“有股权转让协议但是没有办理登记”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、股权转让协议未办理工商登记是否生效？

股权转让协议的生效并不以工商变更为前提。根据相关法律法规，只要股权转让合同是当事人的真实意思表示，并且符合法律规定的转让条件，该合同即具有法律效力。工商变更登记是在股权转让合同生效并履行后才进行的手续，它是对股权转让事实的确认和公示，而非股权转让合同的生效要件。

具体来说，《公司法》第三十三条规定，记载于股东名册的股东可以依股东名册主张行使股东权利。公司应当将股东的姓名或名称向公司登记机关登记；登记事项发生变更的，应当办理变更登记。但未经登记或变更登记的，不得对抗第三人。这意味着，虽然未办理工商登记，但股权转让合同在当事人之间仍然有效，只是不能对抗善意第三人。

二、未办理工商登记对受让方行使股东权利的影响

未办理工商登记不影响受让方行使股东权利。股权转让合同生效后，受让方即取得股东资格，可以依据股权转让合同和股东名册的记载行使股东权利。虽然工商变更登记具有公示效力，但并非股东资格取得的必要条件。在实际操作中，即使未办理工商登记，受让方仍然可以参与公司管理、享受股东权益等。

三、建议与注意事项

1. 尽快办理工商登记：虽然未办理工商登记不影响股权转让合同的效力和受让方行使股东权利，但为了避免潜在的法律风险和纠纷，建议当事人在股权转让后及时办理工商变更登记。

2. 保留相关证据：在办理股权转让过程中，当事人应妥善保留股权转让合同、股东名册变更记录、出资证明等相关证据，以便在必要时证明自己的股东身份和权益。

3. 咨询专业人士：股权转让涉及复杂的法律关系和手续，建议在操作前咨询专业的律师或会计师，以确保整个过程的合法性和规范性。

综上所述，有股权转让协议但未办理工商登记的情况下，股权转让合同仍然有效，受让方可以依据合同和股东名册的记载行使股东权利。但为了避免潜在的法律风险和纠纷，建议尽快办理工商变更登记。