当店铺已经关闭，且发现合伙人挪用了资金时，您可以采取以下步骤来处理这一问题：

首先，查阅合伙协议是关键。合伙协议是合伙人之间的法律约束文件，其中可能包含关于挪用资金或财产的违约责任约定。如果协议中明确规定了挪用资金的后果，比如赔偿责任，那么您可以依据这些条款来追究挪用者的法律责任。

其次，尝试协商解决。如果挪用行为未构成犯罪，或者您希望通过更温和的方式解决问题，可以先与挪用者进行沟通，要求其返还挪用的资金并赔偿因此造成的损失。在协商过程中，保持冷静和理性，尽量通过谈判达成双方都能接受的解决方案。

如果协商无果，向法院起诉是另一个选择。您可以准备相关证据，如财务记录、资金流向凭证等，向法院提起诉讼，要求挪用者返还资金和赔偿损失。法院将会根据事实和法律规定，作出公正的裁决。

此外，如果挪用行为情节严重，可能涉嫌职务侵占罪或挪用资金罪。在这种情况下，您应该及时向公安机关报案，并提供相关证据。司法机关将会依法对挪用者进行刑事追诉，维护您的合法权益。

在整个处理过程中，收集证据至关重要。无论是协商、起诉还是报案，都需要有足够的证据来支持您的主张。因此，建议您详细记录每次挪用的时间、金额、用途等，并确保账目明细清晰准确。

最后，虽然处理合伙人挪用资金的问题可能会很棘手，但请保持冷静和理性。通过查阅合伙协议、尝试协商解决、向法院起诉或向公安机关报案等方式，您可以有效地维护自己的合法权益。同时，也建议您在未来的合伙经营中，加强财务管理和监督，预防类似问题的再次发生。