汽车发动机号不清楚无法过户，起诉到法院后，法院将依据双方提供的证据进行审理，并依法作出判决。具体分析如下：

一. 起诉准备

1. 收集证据：你需要收集与二手车交易相关的所有证据，包括买卖合同、交易记录、车辆登记证书、发动机号不符的证明等。这些证据将用于证明你的权益和对方的违约行为。
2. 撰写起诉状：根据收集到的证据，撰写起诉状，明确诉讼请求，如要求对方承担违约责任、退款或赔偿等。
3. 提交起诉：将起诉状及相关证据提交至有管辖权的法院，并缴纳诉讼费。

二. 法院审理

1. 庭前调解：法院在受理案件后，可能会组织双方进行庭前调解，尝试通过和解方式解决纠纷。
2. 开庭审理：如果调解不成，法院将安排开庭审理。在庭审中，双方将围绕争议焦点进行举证、质证和辩论。
3. 法院判决：法院将根据双方提供的证据和法律规定，对案件进行审理，并依法作出判决。判决结果可能包括支持你的诉讼请求、部分支持或驳回等。

三. 后续执行

1. 履行判决：如果法院判决支持你的诉讼请求，对方需要履行判决，如支付赔偿款或协助办理过户等。
2. 强制执行：如果对方拒不履行判决，你可以向法院申请强制执行，法院将采取一系列强制措施，如冻结银行账户、查封财产等，以迫使对方履行判决。

我建议：在起诉前，尽量先与原车主进行沟通，看是否能够通过协商解决问题。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决。同时，确保收集到充分的证据，以支持你的诉讼请求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。