涉及国家秘密的案件，其秘密性质的确定并非由单一机构或个体来决定，而是依据相关法律法规及案件的具体性质来综合判定。具体来说：

1. 国家秘密的界定：

   • 国家秘密是指关系国家的安全和利益，依照法定程序确定，在一定时间内只限一定范围的人员知情的事项。其密级的具体范围，由国家保密工作部门分别会同外交、公安、国家安全和其他中央有关机关制定。

2. 涉及国家秘密案件的管辖：

   • 在刑事诉讼中，涉及国家秘密的案件管辖法院需根据案件性质、复杂程度及影响范围等因素综合确定。一般而言，中级以上人民法院对此类案件具有管辖权。例如，中级人民法院通常管辖危害国家安全、恐怖活动案件等可能判处无期徒刑、死刑的案件。若案件性质特别严重，可能由高级人民法院或最高人民法院进行管辖。
   • 在民事诉讼和行政诉讼中，涉及国家秘密的案件同样需根据案件的具体性质和复杂程度来确定管辖法院。通常，上级人民法院有权指定管辖法院以确保案件审理的专业性和保密性。

3. 确定国家秘密的程序：

   • 国家秘密的确定需要遵循严格的法定程序，包括秘密的确定、变更和解除等。这些程序旨在确保国家秘密的合法性和保密性，同时防止秘密的滥用和泄露。

综上所述，涉及国家秘密的案件的确定和管辖是一个复杂而严谨的过程，需要综合考虑多种因素。在具体案件中，应依据相关法律法规及司法解释的规定，结合案件实际情况来确定具体的秘密性质和管辖法院。如果你对此类案件有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。