不可以仅通过男方的亲子鉴定就将小三生的孩子落户在男方户口上。以下是对此问题的详细分析：

一. 亲子鉴定的基本要求

• 亲子鉴定是确定亲子关系的重要手段，通常要求被鉴定人（包括父母和孩子）共同参与，以确保鉴定结果的准确性和公正性。
• 在进行亲子鉴定时，一般需要采集父母双方的样本以及孩子的样本，进行比对分析。

二. 落户的法律依据

• 根据《户口登记条例》及相关户籍管理规定，孩子落户需要提供相关的出生证明、父母身份信息等材料。
• 如果涉及非婚生子女的落户问题，通常还需要提供亲子鉴定报告等额外材料，以证明亲子关系。

三. 为何不能只鉴定男方

• 确保亲子关系的准确性：只鉴定男方无法全面反映亲子关系，因为孩子的遗传信息来自父母双方。
• 符合法律程序：户籍管理部门在办理落户时，会严格审查相关材料，包括亲子鉴定报告。如果只提供男方的亲子鉴定，可能无法满足落户的法律要求。
• 保护各方权益：确保亲子关系的准确性有助于保护孩子、父母以及可能涉及的其他家庭成员的合法权益。

四. 建议与操作

• 进行全面的亲子鉴定：为了确保亲子关系的准确性和落户的顺利进行，建议进行包含父母双方和孩子的全面亲子鉴定。
• 咨询户籍管理部门：在准备落户材料前，建议咨询当地户籍管理部门的具体要求，以确保材料齐全、符合规定。

综上所述，仅通过男方的亲子鉴定是无法将小三生的孩子落户在男方户口上的。为了确保亲子关系的准确性和落户的合法性，建议进行全面的亲子鉴定，并咨询当地户籍管理部门的具体要求。如有进一步需要，您可以继续咨询我。