在违法分包的情况下，若仲裁机构不认定存在劳动关系，工伤的认定需依据其他相关证据和法律规定进行。具体分析如下：

一. 违法分包与劳动关系认定的关系

• 违法分包，根据《建设工程质量管理条例》第七十八条的规定，主要指的是总承包单位将工程分包给不具备资质的单位、未经建设单位认可的分包、施工总承包单位将主体结构施工分包，以及分包单位的再分包行为。
• 劳动关系的认定通常基于劳动合同、工作证、工资支付记录等。但在违法分包中，由于分包行为本身违法，可能导致劳动关系认定上的困难。

二. 工伤认定的依据

1. 实际工作情况：即便劳动关系不被仲裁机构认定，如果劳动者实际上在工地上工作并因工作原因受伤，这仍然是认定工伤的重要依据。
2. 相关证据：如医疗记录、目击者证言、工作现场的照片或视频等，都可以作为认定工伤的证据。
3. 法律法规：根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤的认定并不完全依赖于劳动关系的存在，而是更看重实际的工作情况和受伤原因。

三. 建议的处理方式

• 收集证据：首先，应尽可能收集所有与工作和受伤有关的证据。
• 申请工伤认定：携带相关证据，向当地的社会保险行政部门提出工伤认定申请。
• 寻求法律援助：如果工伤认定过程中遇到困难，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的权益。

我建议，在违法分包导致劳动关系认定困难的情况下，劳动者应更加注重实际工作情况的记录和证据的保存。同时，及时咨询专业律师，了解具体的法律程序和自己的权益，以便在需要时采取适当的法律行动。如有进一步需要，您可以继续咨询我。