罚款的限额由国务院规定。

详细分析

一、法律依据

根据《中华人民共和国行政处罚法》第十三条的明确规定，国务院部门规章在法律、行政法规尚未制定的情况下，对违反行政管理秩序的行为可以设定警告或者一定数额的罚款。而罚款的具体限额，则由国务院来规定。这一条款清晰地界定了罚款限额的制定机关。

二、罚款限额的规定方式

国务院通常通过以下几种方式来规定罚款的限额：

1. 制定行政法规：国务院可以制定具体的行政法规，其中明确不同违法行为对应的罚款幅度。
2. 发布决定或命令：除了行政法规外，国务院还可以通过发布决定或命令的方式来规定罚款的限额。

这些规定确保了行政处罚的公正性和合理性，使得罚款数额与违法行为的性质、情节以及社会危害程度相适应。

三、罚款限额的适用原则

在适用罚款限额时，需要遵循以下原则：

1. 法定原则：罚款的限额必须严格依照法律和国务院的规定执行。任何超出法定限额的罚款都是违法的，不具有法律效力。
2. 过罚相当原则：罚款的数额应当与违法行为的性质、情节以及社会危害程度相适应。这一原则确保了行政处罚的公正性和合理性，避免了畸轻畸重的处罚现象。

四、其他相关规定

值得注意的是，对于地方政府规章而言，虽然它们可以在法律、法规规定的范围内作出具体规定，但无权直接设定罚款的限额。这一权限是专属于国务院的。地方政府在制定相关规章时，必须严格遵守国务院关于罚款限额的规定。

综上所述，罚款的限额由国务院规定，这是由《中华人民共和国行政处罚法》明确规定的。在实际操作中，国务院通过制定行政法规、发布决定或命令等方式来具体规定罚款的限额，以确保行政处罚的公正性和合理性。同时，在适用罚款限额时，需要遵循法定原则和过罚相当原则，确保行政处罚的合法性和公正性。