公务员因公死亡的认定机构是社会保险行政部门。具体分析如下：

一. 认定机构

• 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工因工死亡的认定，包括公务员因公死亡的认定，均由社会保险行政部门负责。这一机构专门负责处理与工伤保险相关的各项事务，包括工伤的认定、评残以及工伤保险待遇的支付等。

二. 认定依据

• 公务员因公死亡的认定，同样遵循《工伤保险条例》第十四条的规定。即职工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者因工外出期间，由于工作原因受到伤害等情形，都应当认定为工伤。对于公务员来说，这些情形同样适用，一旦符合这些条件，即可被认定为因公死亡。

三. 认定流程

• 公务员因公死亡后，其所在单位应当及时向社会保险行政部门提出工伤认定申请，并提交相关证明材料，如事故报告、医疗证明等。
• 社会保险行政部门在收到申请后，将进行详细的调查核实，包括事故现场勘查、证人证言收集等，以确保认定的准确性。
• 一旦认定为因公死亡，公务员的家属将依法享受相应的工伤保险待遇，包括丧葬补助金、供养亲属抚恤金以及一次性工亡补助金等。

综上所述，公务员因公死亡的认定机构是社会保险行政部门，认定依据为《工伤保险条例》的相关规定，认定流程包括申请、调查核实以及待遇支付等环节。如有进一步需要，您可以继续咨询我。