撞了营运车赔偿停运费时，通常不需要额外扣除成本。以下是对此问题的详细分析：

一. 停运费赔偿原则

1. 赔偿范围：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，机动车发生交通事故造成损害，属于机动车一方责任的，应由保险公司或侵权人赔偿相应的损失。对于营运车辆而言，停运费是其因交通事故而无法正常运营所产生的直接经济损失，理应得到赔偿。
2. 不扣除成本的理由：停运费赔偿的是营运车辆因事故而停止运营所减少的收入，这部分收入是营运车辆的正常收益，不应扣除任何成本。成本是营运车辆在日常运营中已经支出的费用，与停运费赔偿无关。

二. 法律依据

• 《中华人民共和国民法典》第一千二百一十三条：机动车发生交通事故造成损害，属于该机动车一方责任的，先由承保机动车强制保险的保险人在强制保险责任限额范围内予以赔偿；不足部分，由承保机动车商业保险的保险人按照保险合同的约定予以赔偿；仍然不足或者没有投保机动车商业保险的，由侵权人赔偿。此条款说明了交通事故损害赔偿的基本原则，包括停运费在内的经济损失应由责任方赔偿。

三. 实际操作建议

• 在处理交通事故赔偿事宜时，应确保停运费的计算合理且准确，通常依据营运车辆的历史运营收入、停运时间等因素来确定。
• 我建议双方应协商确定停运费的赔偿金额，如协商不成，可寻求法律援助或通过诉讼途径解决争议。

综上所述，撞了营运车赔偿停运费时，通常不需要扣除成本。如有进一步需要，您可以继续咨询我。