被告当庭提交证据的后果，主要取决于案件的具体类型、证据的性质以及法庭的裁量。以下是对不同情形下被告当庭提交证据可能面临的后果的详细分析：
民事诉讼中：
- 一般情况下：根据民事诉讼法的规定，当事人应当在举证期限内提交证据。如果被告无正当理由当庭提交证据，且该证据不属于新证据或因客观原因无法在举证期限内提供的情形，法院通常不会采纳该证据。此时，被告可能会面临训诫、罚款等处罚，并且该证据不会对案件产生实质性影响。
- 特殊情况下：如果被告当庭提交的证据属于新证据，即举证期限届满后才发现的证据，或因客观原因在举证期限内无法提供且在庭审中才具备提供条件的证据，法院会视情况决定是否组织质证及采纳该证据。若法院决定采纳，该证据可能会对案件结果产生重要影响。
刑事诉讼中：
- 一般情况下：在刑事诉讼中，辩方证据一般应在开庭前交检察院审查。如果被告当庭提交新证据，且该证据对案件定罪量刑有重大影响，符合相关程序要求时，法院可能会允许在庭审中提交并组织质证。但这种情况下较为罕见，通常需要满足严格的条件。
- 特殊规定：对于某些特定类型的案件或证据，法律可能有特殊规定。例如，对于涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私的证据，可能需要在庭审中特别处理。
行政诉讼中：
- 在行政诉讼中，被告对作出的行政行为负有举证责任，并应当在收到起诉状副本之日起十五日内向人民法院提交作出行政行为的证据。如果被告当庭提交证据且无正当理由逾期提供证据，法院可能会视为被告没有相应证据，并据此作出判决。
综上所述，被告当庭提交证据的后果具有不确定性，取决于多种因素的综合考量。因此，建议被告在诉讼过程中尽量遵守举证期限的规定，提前准备好全部证据，并在庭审中根据法庭的指示进行举证和质证。如果有特殊原因需要当庭提交证据，应提前与法庭沟通并说明理由，以确保证据的合法性和有效性。