已经设定抵押的房屋被法院另案执行，不影响抵押权的效力。抵押权人依然享有对该房屋的优先受偿权，但需密切关注房屋的执行状况，并在必要时采取合适的法律措施保护自身权益。
法律原理与基础
物权优先性原则：
- 抵押权作为一种担保物权，具有优先于一般债权的效力。当抵押房屋被法院另案执行时，这些执行措施主要涉及普通债权的实现问题，而抵押权作为物权，其效力不因后续的债权执行行为受到影响。
抵押权的追及效力：
- 抵押权具有追及效力，即无论抵押财产流转到何人之手，抵押权人都可以追及该财产并就其优先受偿。即使抵押房屋被法院另案执行，抵押权人对该房屋的抵押权依然存在，并有权在符合法定条件时就房屋的变价款优先受偿。
相关法律规定
- 《中华人民共和国民法典》相关规定：
- 根据《民法典》的相关解释，已经设定抵押的财产被采取查封、扣押等财产保全或者执行措施的，不影响抵押权的效力。这一规定同样适用于抵押房屋被法院另案执行的情况。
具体实践中的处理方式与建议
抵押权的实现：
- 在抵押房屋被法院另案执行后，若债务履行期限届满，抵押权人可以向法院申请实现抵押权，通过拍卖、变卖等方式处置抵押房屋，并就所得价款优先受偿。法院在执行过程中应保障抵押权人的优先受偿权。
与其他债权人的协调：
- 在存在多个债权人的情况下，抵押权人优先受偿后，剩余的价款才用于清偿其他普通债权人的债权。若抵押房屋价值不足以清偿所有债务，其他债权人可能无法获得全额清偿，但这并不影响抵押权人的优先地位。
抵押权人的关注与行动：
- 抵押权人需密切关注抵押房屋的执行状况，一旦发现房屋被法院另案执行，应及时向法院了解执行情况，并积极参与执行程序，以确保自身权益得到有效保护。
综上所述，已设定抵押的房屋被法院另案执行，并不影响抵押权的效力。抵押权人应充分了解相关法律规定，并在必要时采取合适的法律措施，以保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。