商户收据存根遗失确实是一个需要妥善处理的问题，以下是根据您提供的参考信息整理出的详细解答：

情形一：收据公司（即收款方）弄丢收款收据

1. 确认遗失信息：

   • 首先，收据公司需要与开据公司（即出具收据的一方）确认遗失收据的号码、金额、开具日期等有效信息。
   • 确认该收据的存根确实存在，以避免后续纠纷。

2. 开具遗失说明：

   • 开据公司需开具一份遗失说明，详细说明遗失的具体情况。
   • 遗失说明应附上开据公司的营业执照复印件、委托书、经办人身份证复印件，并均加盖公章。
   • 同时，提供收据存根联的复印件，并加盖公司财务章。

3. 财务做账凭据：

   • 上述文件准备齐全后，可作为收据公司的财务做账凭据。

4. 登报声明（如款项巨大且未结款）：

   • 若款项巨大且对方尚未结款，收据公司可能要求开据公司登报发布遗失声明。
   • 声明应在市级以上报纸上公开发布，见报后原有收据存根作废。
   • 凭报纸可重新开具新收据。

情形二：开据公司（即出具收据的一方）弄丢收款收据

1. 联系税务机关：

   • 开据公司需立即联系当地税务机关，告知收据的号码、金额或开具日期等有效信息。
   • 税务机关将为此做遗失备案。

2. 登报声明：

   • 为确保丢失的收据不被非法冒用，开据公司应登报发布遗失声明。
   • 声明见报之时起，该收据即作废，不会造成任何不良影响。

3. 重新开具收据：

   • 原收款收据无效后，开据公司可重新开具新收据。

注意事项

• 内部收据遗失：若遗失的是内部收据，主要用于内部成本入账，问题不大。但若是单位之间的收据遗失，则需采取上述补救措施。
• 登报选择：选择正规的、知名度大的登报平台，确保业务的安全性、有效性和服务的可追踪性。同时，注意登报的相关要求，如报纸级别、声明格式等。

综上所述，商户收据存根遗失后，应根据具体情况采取相应的补救措施，以确保财务做账的准确性和避免可能的纠纷。