企业收据存根未保存的，需根据具体情况采取补救措施，核心结论如下：

1. 若未产生纠纷或税务检查，可立即补救并规范管理

   • 补救措施：立即整理现有财务资料（如银行流水、合同、付款记录等），通过其他证据链还原交易真实性。例如，若收据对应的是客户付款，可联系客户补开收据或提供付款凭证复印件并加盖公章。
     
   • 规范管理：建立收据管理制度，明确收据的领用、开具、保存流程，指定专人负责，并定期核对存根与财务记录。建议使用电子化收据系统，减少纸质存根丢失风险。
     

2. 若已面临税务稽查或法律纠纷，需主动配合并说明情况

   • 税务稽查：根据《税收征收管理法》第六十条，未按规定保存发票（含收据）的，税务机关可责令限期改正，并处2000元以下罚款；情节严重的，处2000元以上1万元以下罚款。此时应主动向税务机关说明情况，提交其他证明交易真实的材料（如合同、物流单据等），争取减轻处罚。
     
   • 法律纠纷：若因收据存根缺失导致举证困难（如对方主张未付款），需通过其他证据（如证人证言、录音录像、第三方支付记录等）证明交易事实。若无法证明，可能承担不利后果（如败诉或需重复付款）。
     

3. 长期预防建议：完善财务与法律合规体系

   • 财务合规：定期接受财务审计，确保收据、发票等凭证的完整性和真实性。建议使用财务软件自动生成收据编号并留存电子档案，避免人为丢失。
     
   • 法律合规：在合同中明确付款方式及凭证要求（如“付款后需提供加盖公章的收据”），降低纠纷风险。若涉及大额交易，可要求对方提供担保或分期付款，并保留每期付款凭证。
     

总结：收据存根未保存的补救关键在于“还原交易真实性”和“主动配合监管”。若您已遇到具体问题（如税务处罚、纠纷诉讼），可进一步向我说明细节，我将结合具体场景提供针对性方案。