商住楼商铺改建为公寓在某些条件下是合法的，但也可能存在违法情况。具体是否合法，需要根据实际情况和相关法律法规进行综合判断。
合法情况：
- 规划许可：如果商住楼商铺在原始规划或后续经过合法审批的程序中，被明确允许或变更为可以改建为公寓，那么这种改建行为是合法的。这通常涉及到向相关部门（如规划部门、住建部门）提交申请，并获得相应的规划许可或变更批准。
- 建筑规范：改建过程必须严格遵守建筑规划和设计规范，包括建筑结构安全、消防要求、日照间距、建筑密度等方面。只有确保改建后的公寓符合所有建筑规范和安全标准，才能被视为合法。
违法情况：
- 未经审批：如果商住楼商铺的改建行为未经相关部门审批，或者改建内容超出了原规划或审批的范围，那么这种改建行为是违法的。这可能会导致相关部门责令停工、罚款，甚至要求拆除违法建筑。
- 违反规划：如果商住楼商铺所在的区域在城市规划中明确被划定为只能用于特定商业用途，而改建为公寓会改变这一用途，那么这种改建行为也是违法的。除非经过法定程序变更土地用途，否则不能擅自改变。
因此，在进行商住楼商铺改建为公寓之前，建议咨询当地相关部门，了解具体的规划和建筑要求，并依法依规办理相关审批手续。同时，也可以咨询专业律师，以确保改建行为的合法性和安全性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。