评估公司评估探矿权是合法的，但前提是评估公司必须具备相应的资质，并遵循相关法规进行评估。

一. 评估公司评估探矿权的合法性

1. 评估资质要求：评估公司在进行探矿权评估时，必须确保自身具备从事矿业权评估的资质。这是评估工作合法性的基础。只有具备相关资质的评估公司，才能按照法定程序和标准进行探矿权评估。
2. 遵循相关法规：评估公司在评估探矿权时，必须严格遵循《矿业权评估管理办法(试行)》等相关法规。这些法规对矿业权评估的程序、标准、责任等进行了明确规定，确保评估工作的公正、客观和准确性。

二. 评估过程中的注意事项

1. 明确评估目的和范围：评估公司在接受探矿权评估委托时，应明确评估的目的和范围，确保评估工作有的放矢。
2. 遵循评估程序：评估公司应严格按照法规规定的评估程序进行评估，包括收集资料、现场勘查、分析测算等环节，确保评估结果的可靠性。
3. 客观公正地出具评估报告：评估公司在完成评估工作后，应客观公正地出具评估报告，并对评估结果的独立、客观、公正、真实性承担法律责任。

综上所述，评估公司评估探矿权是合法的，但前提是必须具备相应的资质，并严格遵循相关法规进行评估。如有进一步需要，您可以继续咨询我。