补充协议在符合相关法律法规和特定条件下，是可以推翻或修改原协议条款的。这种修改需要双方协商一致，明确变更内容，并且不得违反法律法规的强制性规定或损害第三人的合法权益。以下是对这一结论的详细解释：

1. 协商一致：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第五百四十三条，当事人协商一致，可以变更合同。因此，补充协议要推翻原协议条款，首先必须确保双方已经就此达成了一致意见。

2. 明确的变更内容：

   • 补充协议应清晰、明确地指出要更改的原协议条款以及更改后的具体内容，以避免产生歧义或误解。这是确保补充协议有效性和可执行性的关键。

3. 不违反法律法规强制性规定：

   • 补充协议对原协议条款的更改必须遵守法律、行政法规的强制性规定。任何试图通过补充协议违反法律法规的更改，如降低产品质量标准至低于国家强制标准的程度，均属无效。

4. 不损害第三人利益：

   • 如果补充协议的更改损害了第三人的合法权益，该更改可能会被认定为无效。因此，在签订补充协议时，应确保不会损害到第三方的利益。

5. 与原协议的关系：

   • 补充协议一旦成立并生效，即成为原协议不可分割的一部分，与原协议具有同等的法律效力。在冲突时，通常以补充协议为准，除非双方在补充协议中另有特别约定。

举个例子来说明：假设甲乙双方签订了一份房屋租赁合同，约定租金为每月5000元。后来因市场行情变化，双方协商一致，决定通过补充协议将租金调整为每月4500元。只要这份补充协议符合上述条件，即双方协商一致、内容明确且不违反法律法规强制性规定，那么它就可以有效地推翻原协议中关于租金的条款。

综上所述，补充协议在符合相关法律法规和特定条件下，是可以推翻或修改原协议条款的。在实际操作中，建议双方在签订补充协议前充分沟通、协商，并确保新约定的合法性、有效性和可操作性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。