关于病毒感染肺炎疫情防控期间劳动争议案件法律适用问题的解答，主要依据人力资源社会保障部办公厅的相关通知以及地方性的具体解答进行。以下是对相关问题的详细解答：

一. 工资支付与合同保障

1. 对于因疫情防控不能提供正常劳动的职工：

   • 企业应当支付职工在此期间的工作报酬，并且不得依据《劳动合同法》第四十条、四十一条与职工解除劳动合同。这一规定适用于新型冠状病毒感染的肺炎患者、疑似病人、密切接触者在其隔离治疗期间或医学观察期间，以及因政府实施隔离措施或采取其他紧急措施导致不能提供正常劳动的企业职工。
   • 法律依据：《人力资源社会保障部办公厅关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》第一条。

2. 劳动合同到期的处理：

   • 在此期间，若劳动合同到期，应顺延至职工医疗期期满、医学观察期期满、隔离期期满或者政府采取的紧急措施结束。
   • 法律依据：同上，第一条。

二. 企业停工停产期间的工资支付

1. 未超过一个工资支付周期：

   • 企业应按劳动合同规定的标准支付职工工资。
   • 法律依据：《人力资源社会保障部办公厅关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》第二条。

2. 超过一个工资支付周期：

   • 若职工提供了正常劳动，企业支付给职工的工资不得低于当地最低工资标准。
   • 职工没有提供正常劳动的，企业应当发放生活费，生活费标准按各省、自治区、直辖市规定的办法执行。
   • 法律依据：同上，第二条。

三. 灵活办公与工资支付

• 用人单位安排劳动者在家上班或灵活办公的，一般应视为劳动者正常出勤，对劳动者要求支付工资差额的请求应予支持，除非双方经协商一致降低劳动报酬。
• 法律依据：北京市高级人民法院与北京市劳动人事争议仲裁委员会联合发布的《关于审理新型冠状病毒感染肺炎疫情防控期间劳动争议案件法律适用问题的解答》。

四. 仲裁时效与案件审理

1. 仲裁时效中止：

   • 因受疫情影响造成当事人不能在法定仲裁时效期间申请劳动人事争议仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。
   • 法律依据：《人力资源社会保障部办公厅关于妥善处理新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控期间劳动关系问题的通知》第三条。

2. 案件审理顺延：

   • 受疫情影响导致劳动人事争议仲裁机构难以按法定时限审理案件的，可相应顺延审理期限。
   • 法律依据：同上，第三条。

综上所述，病毒感染肺炎疫情防控期间的劳动争议案件法律适用问题，主要遵循人力资源社会保障部办公厅的相关通知以及地方性的具体解答。在处理具体案件时，应根据实际情况和相关法律法规进行妥善处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。