在不知情的情况下被代开了发票，应当立即采取一系列措施来保护自己，并配合相关部门调查。具体分析如下：

一. 立即查明情况并保留证据

1. 查明发票情况：首先，你需要尽快查明发票的具体情况，包括发票的开具单位、发票金额、开具时间等，以确认是否真的存在被代开发票的情况。
2. 保留相关证据：保留所有与发票相关的证据，如发票原件、交易记录、通信记录等。这些证据在后续处理中可能起到关键作用。

二. 向相关部门报告

1. 向税务机关报告：根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关规定，你应当及时向当地税务机关报告被代开发票的情况。税务机关将对此进行调查，并根据调查结果采取相应的处理措施。
2. 配合调查：在税务机关调查过程中，你需要如实提供相关信息和证据，配合调查工作。

三. 关注法律责任

1. 可能涉及的法律责任：虽然你是在不知情的情况下被代开了发票，但根据具体情况，你可能需要承担一定的法律责任，如补缴税款、滞纳金等。因此，你需要密切关注税务机关的调查结果，并咨询专业律师以了解可能的法律后果。
2. 及时咨询律师：在配合调查的同时，我建议你及时咨询律师，以便更好地了解自己的法律权益和可能的法律后果。律师将为你提供专业的法律建议，帮助你妥善处理此事。

四. 加强内部管理

1. 审查业务流程：为了避免类似情况再次发生，你需要对现有的业务流程进行全面审查，查找可能存在的漏洞和风险点。
2. 加强员工培训：加强对员工的法律和财务培训，提高员工的法律意识和风险防范能力。

我建议，在处理此事时，你要保持冷静和理性，积极配合相关部门的调查工作。同时，加强内部管理，确保类似情况不再发生。如有进一步需要，您可以继续咨询我。