民营企业合法收入应得到全面保障，即使存在违法现象，也不能直接扣除其合法收入。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一. 民营企业合法收入的保护原则

1. 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》及《中华人民共和国企业法》的相关规定，企业的合法财产受法律保护，任何组织或者个人不得侵占、哄抢、破坏或者非法查封、扣押、冻结、没收。这为企业合法收入提供了明确的法律保护。
2. 合法收入的界定：民营企业的合法收入，是指企业通过合法经营、依法纳税等方式获得的收入，这些收入应当受到法律的保护，不受任何非法侵害。

二. 违法现象与合法收入的关系

1. 独立性原则：企业的合法收入与其可能存在的违法现象是两个独立的概念。即使企业存在违法现象，也不能直接扣除其合法收入作为处罚或补偿。
2. 法律程序：如果企业存在违法行为，相关部门应依法进行查处，并按照法律程序进行处罚，如罚款、没收违法所得等。但这一过程必须严格遵循法律程序，不能随意扣除企业的合法收入。

三. 保障措施与建议

1. 加强法律保护：国家应进一步完善相关法律法规，明确保护企业合法收入的法律规定，加大对违法行为的打击力度，确保企业合法收入得到有效保护。
2. 企业自我保护：民营企业自身也应加强法律意识，依法经营，确保收入的合法性。同时，应建立健全内部管理制度，防范和应对可能存在的法律风险。
3. 寻求法律救济：如果企业的合法收入受到侵害，应及时寻求法律救济，通过法律途径维护自己的合法权益。

我的观点：民营企业的合法收入是其经营活动的基石，应得到全面的法律保护。即使企业存在违法现象，也不能直接扣除其合法收入。相关部门应依法进行查处，并遵循法律程序进行处罚，确保企业的合法权益不受侵害。同时，民营企业自身也应加强法律意识和内部管理，确保收入的合法性并防范法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。