违法拆除后又签订拆迁补偿协议，仍然有可能主张行政赔偿。具体分析如下：

首先，我们要明确的是，行政赔偿的前提通常是行政行为被确认违法。然而，在实践中，并非只有“确认强拆违法+行政赔偿”这一种组合方式。即使拆迁行为本身未被确认为违法，但如果与拆迁相关的协议（如拆迁补偿协议）被法院确认无效，且行政机关对此存在过错，那么受影响的个人或企业仍然有权向行政机关申请行政赔偿。

以一起实际案例为例：某村民的宅基地因道路建设项目被镇政府拆除，随后与村委会签订了《挑房协议》。然而，该协议后来被法院确认无效，且镇政府未履行其采取补救措施的义务。在这种情况下，尽管镇政府的拆迁行为本身并未被确认为违法，但村民仍然有权向镇政府申请行政赔偿，因为协议无效且镇政府存在过错。最终，法院也支持了村民的赔偿请求。

因此，即使你的房屋被违法拆除后又签订了拆迁补偿协议，如果协议存在无效或被撤销的情况，且行政机关对此有过错，你仍然有权主张行政赔偿。当然，具体能否获得赔偿以及赔偿的数额等细节，还需要根据案件的实际情况和法律规定来具体判断。

如果你在这方面遇到了问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议和指导。