在综合工时制度下，劳动者在法定节假日是应当休息的。以下是详细分析：
一. 法定节假日休息的规定
- 综合工时制度的特点：综合工时制度是一种特殊的工时制度，它允许企业根据生产或工作的实际情况，灵活安排劳动者的工作时间和休息时间。然而，这种灵活性并不意味着可以完全无视劳动者的休息权益。
- 法定节假日的强制性：根据相关法律法规，法定节假日是劳动者应当休息的时间，无论企业采用何种工时制度，都应当遵守这一规定。在法定节假日期间，企业应当安排劳动者休息，并支付相应的节假日工资。
二. 法律依据
- 《劳动法》第四十条规定，用人单位在下列节日期间应当依法安排劳动者休假：（一）元旦；（二）春节；（三）国际劳动节；（四）国庆节；（五）法律、法规规定的其他休假节日。这一条款明确规定了劳动者在法定节假日的休息权益。
三. 实际应用
- 在综合工时制度下，企业虽然可以灵活安排工作时间，但必须在法定节假日期间安排劳动者休息。如果企业违反这一规定，劳动者有权向劳动监察部门投诉，并要求企业承担相应的法律责任。
综上所述，在综合工时制度下，劳动者在法定节假日是应当休息的，这是法律法规的明确要求。企业应当严格遵守这一规定，保障劳动者的休息权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。