基本工资1000元是否合法，取决于多个因素的综合考量。以下是对此问题的详细分析：

1. 与当地最低工资标准的比较：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十八条，国家实行最低工资保障制度。具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，并报国务院备案。
   • 若基本工资1000元不低于所在地区的月最低工资标准，则合法；反之，若低于该标准，则用人单位的支付行为违法。

2. 劳动合同约定的考量：

   • 劳动者与用人单位签订的劳动合同中会约定基本工资。若劳动合同明确约定基本工资为1000元，且用人单位依法支付加班工资、奖金、津贴等其他劳动报酬，且劳动者实际获得的劳动报酬不低于法定标准，那么该约定在一定程度上是有效的。
   • 但若劳动合同未明确，仅以1000元作为所有劳动报酬支付，且实际发放情况与劳动者的工作内容、时间、强度等严重不匹配，或存在故意压低工资以逃避劳动法律责任等不合理情形，则可能涉及违法。

3. 特殊情况的考虑：

   • 对于特殊行业、特殊岗位或临时性、非全日制工作，只要支付的工资不低于当地规定的相应小时最低工资标准，即可能是合法的。

4. 历史合同的处理：

   • 如果劳动合同是以前签订的，且当时约定的基本工资1000元是有效的，但现在已低于当地最低工资标准，那么该约定不再具有法律效力。用人单位应按照当前最低工资标准支付工资。

5. 劳动者权益保护：

   • 劳动者应了解自己的工资构成、实际发放情况以及当地最低工资标准等，以确保自己的权益不受侵害。
   • 若认为工资待遇不合法，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维护自己的权益。

综上所述，基本工资1000元是否合法，不能一概而论，而需结合具体情况进行综合判断。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。