若您的车辆并未进行非法营运，保险公司的指控是不合理的，您有权进行申诉。针对此问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 保险公司指控的非法营运定义

1. 非法营运的界定：根据《中华人民共和国道路运输条例》等相关法律法规，非法营运通常指的是未取得道路运输经营许可，擅自从事道路运输经营活动的行为。这包括未取得相应许可而擅自从事客运、货运等经营活动。
2. 您的车辆情况：您提到车辆一年多行驶了2万多公里，这并不直接构成非法营运的证据。行驶里程只是车辆使用情况的反映，与是否非法营运无直接关联。

二. 保险公司的指控依据

1. 保险公司的调查：保险公司若指控您非法营运，应提供确凿的证据，如监控录像、乘客证言、运营记录等，以证明您的车辆在未取得许可的情况下进行了营运活动。
2. 证据的合法性：您有权要求保险公司出示这些证据，并审查其合法性和关联性。若证据不足或存在瑕疵，您有权提出异议。

三. 您的申诉权利

1. 正式申诉：若您认为保险公司的指控不实，可以向保险公司提出正式申诉，要求重新审查您的案件。
2. 法律途径：若申诉无果，您还可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向当地银保监局投诉或寻求司法救济。

四. 建议与后续行动

1. 收集证据：为了支持您的申诉，建议您收集相关证据，如车辆行驶证、保险单、车辆使用记录等，以证明您的车辆并未进行非法营运。
2. 与保险公司沟通：在提出申诉前，您可以先与保险公司进行沟通，了解其具体指控和依据，并尝试通过协商解决问题。
3. 正式申诉与法律途径：若沟通无果，您应及时提出正式申诉，并考虑通过法律途径维护自己的权益。

我建议您首先与保险公司进行沟通，了解其指控的具体内容和依据。若您确信自己的车辆并未进行非法营运，应坚决维护自己的权益，通过正式申诉或法律途径进行维权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。