核心结论：若保险公司已赔付后发现被保险车辆存在非法营运行为，保险公司有权通过法律途径追回已支付的赔款，并可能对相关责任人追究法律责任。

具体分析：

1. 保险合同条款的审查：

   • 首先，需要仔细审查保险合同中关于车辆使用性质的约定。通常，保险合同会明确规定被保险车辆的使用范围，如非营运车辆不得用于营运活动。
   • 若合同中明确禁止非法营运，且被保险人违反了这一约定，保险公司有权依据合同条款拒绝赔付或追回已赔付的款项。

2. 非法营运的认定：

   • 非法营运通常指的是未取得相关营运资质而从事营运活动的行为。这需要交通管理部门或相关执法机构的认定。
   • 若保险公司发现被保险车辆存在非法营运行为，应首先收集相关证据，如交通管理部门的处罚决定书、营运记录等，以证明非法营运的事实。

3. 保险公司的追偿权：

   • 根据《保险法》及相关规定，若被保险人故意或因重大过失未履行如实告知义务，足以影响保险人决定是否同意承保或者提高保险费率的，保险人有权解除合同，并不承担赔偿或给付保险金的责任。
   • 在非法营运的情况下，若被保险人未如实告知车辆的使用性质，或明知故犯，保险公司有权在赔付后追回已支付的赔款。

4. 法律程序的遵循：

   • 保险公司在追回赔款时，应遵循法律程序，如通过诉讼或仲裁等方式解决争议。
   • 在此过程中，保险公司需要提供充分的证据证明非法营运的事实以及被保险人的违约行为。

5. 对被保险人的建议：

   • 若被保险人发现自己的车辆被用于非法营运，应立即停止该行为，并主动向保险公司说明情况，以避免可能的法律纠纷。
   • 若保险公司已提出追偿要求，被保险人应积极配合，并考虑咨询专业律师以维护自己的合法权益。

总结与建议：

• 保险公司赔付后发现非法营运，有权依据合同条款和法律规定追回赔款。
• 被保险人应严格遵守保险合同中的约定，避免非法营运行为，以免引发法律纠纷。
• 若遇到此类问题，建议被保险人及时咨询并向我提问，以便更好地维护自己的权益。