殡仪馆遗体超过三年不予受理的做法，通常基于地方性的殡葬管理规定或殡仪馆的内部规定，而非全国性的法律法规。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 殡葬管理规定的差异性

• 在我国，殡葬管理主要遵循《殡葬管理条例》及地方性的殡葬管理规定。然而，《殡葬管理条例》并未明确规定遗体在殡仪馆的存放时间限制。
• 地方性的殡葬管理规定或殡仪馆的内部规定可能根据当地的实际情况和殡仪馆的运营需要，对遗体的存放时间做出具体规定。因此，殡仪馆遗体超过三年不予受理的做法，很可能是基于这样的地方性规定或内部规定。

二. 遗体长期存放的问题

• 遗体长期存放可能会带来一系列问题，如遗体保存状况恶化、管理成本增加、占用殡仪馆资源等。
• 殡仪馆为了维护自身的运营秩序和资源利用效率，可能会设定一定的存放时间限制，以促使家属及时处理遗体的安葬或火化事宜。

三. 建议与措施

• 我建议家属在遗体存放问题上应遵守殡仪馆的相关规定，及时与殡仪馆沟通并处理遗体的安葬或火化事宜。
• 如遇特殊情况需长期存放遗体，应提前与殡仪馆协商并了解相关规定，以避免因超过存放时间限制而产生不必要的麻烦。
• 同时，家属也可以考虑选择其他殡葬服务方式，如骨灰寄存、海葬、树葬等，以减轻殡仪馆的压力并满足自身的殡葬需求。

综上所述，殡仪馆遗体超过三年不予受理的做法主要基于地方性的殡葬管理规定或殡仪馆的内部规定。家属在处理遗体存放问题时，应遵守相关规定并与殡仪馆进行及时沟通。如有进一步需要，您可以继续咨询我。