三个月不上班并不会自动离职。劳动合同的解除需遵循法定程序和条件，具体处理方式需根据公司规章制度和劳动合同条款来确定。

一. 不存在“自动离职”的情形

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，劳动合同的解除必须满足法定或约定的条件，并严格遵循法律程序。法律层面上，并不存在因员工长时间不上班就自动离职的规定。

二. 劳动合同解除的主要情形

1. 双方协议解除：用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
2. 员工自行解除：劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期内为提前三日），可以解除劳动合同。
3. 雇主单方解除：在特定情形下，如劳动者严重违反用人单位规章制度，用人单位有权单方面解除劳动合同。

三. 员工三个月不上班的常见处理方式

1. 旷工处理：

    - 若公司规章制度明确规定连续旷工达到一定天数（如连续旷工15天或累计旷工30天）为严重违纪行为，且该制度已经民主程序制定并向员工公示，则用人单位可依据《劳动合同法》第三十九条第二项解除与该员工的劳动合同。
   

2. 医疗期相关情况：

    - 若员工因病或非因工负伤在规定的医疗期内，用人单位不得随意解除劳动合同。
    - 医疗期届满后，若员工仍不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位可依据《劳动合同法》第四十条第一项解除劳动合同，但需支付经济补偿。
   

四. 特殊情况的考虑

• 如因不可抗力等客观原因导致员工无法上班，或员工与用人单位有特殊请假约定且双方认可，用人单位不能简单以员工长时间未上班为由解除劳动合同。

综上所述，三个月不上班并不会导致自动离职。用人单位在处理此类问题时，应严格依据相关法律法规和公司规章制度，并确保遵守法定程序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。