合伙人在店里亏损时退股是否合法，取决于合伙协议的具体约定以及相关法律法规的规定。
合伙协议有约定：
- 如果合伙协议中明确规定了退股的条件和程序，并且这些条件是合法的，那么当这些条件被满足时，合伙人可以按照协议退股，即使店铺处于亏损状态。例如，协议中可能约定经营期满或达到某些特定条件时可以退股。
合伙协议无约定：
- 如果合伙协议中没有关于退股的明确约定，那么合伙人想要退股就需要经过全体合伙人的同意。在这种情况下，即使店铺亏损，只要其他合伙人同意，退股也是合法的。
- 此外，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合伙人在不给合伙企业事务执行带来不利影响的情况下，可以提前三十日通知其他合伙人申请退伙。这意味着，在没有特定约定的情况下，合伙人仍有可能因个人原因（包括亏损）而退出合伙，但需遵循一定的程序和通知要求。
退股时的责任：
- 无论合伙协议是否有约定，退股时合伙人都需要对退伙前的合伙企业债务承担无限连带责任。这意味着，即使合伙人退出了合伙，如果合伙企业在其退伙前存在债务，债权人仍然有权要求该合伙人承担清偿责任。
- 退股时还需要进行合伙财产的清算，根据合伙协议的约定或全体合伙人的协商确定比例来分配合伙企业的财产。如果财产不足以清偿债务，合伙人需要按照各自的出资比例或协议约定的比例来承担清偿责任。
综上所述，合伙人在店里亏损时退股是否合法，主要取决于合伙协议的具体约定以及相关法律法规的规定。如果合伙协议有明确的退股条件并且被满足，或者经过全体合伙人的同意，并且遵循了相关的程序和通知要求，那么退股是合法的。但在退股时，合伙人需要承担相应的责任和义务，包括对合伙企业债务的承担和合伙财产的清算等。