付款单公司负责人盖章是可以的，但具体怎么盖需遵循一定规范和流程。

一. 付款单盖章的合法性

• 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这一规定同样适用于付款单，表明盖章是确认付款单内容并使其具有法律效力的重要方式。

二. 盖章的具体要求和流程

1. 盖章类型：在付款单上，通常应加盖公司公章或财务专用章以确认其效力。公章代表公司的法定身份，具有最高法律效力；而财务专用章则专用于财务相关事务，其效力也被法律所认可。
2. 盖章位置：盖章应位于付款单的适当位置，通常是在付款单的末尾或指定盖章区域。需确保印章清晰、完整，且能够明确表明是公司对付款单的正式确认。
3. 盖章人员：公司负责人或授权代表应在付款单上盖章。如果是负责人亲自盖章，需确保其身份真实有效；如果是授权代表盖章，需持有公司出具的授权委托书，并在授权范围内进行盖章操作。
4. 盖章程序：盖章前，应仔细核对付款单的内容，确保无误后再进行盖章。盖章时，应确保印章与付款单紧密接触，用力均匀，以保证印章的清晰度。盖章后，应再次检查印章是否清晰、完整，并妥善保管好付款单原件。

三. 注意事项

• 付款单上的盖章应与公司公章或财务专用章保持一致，避免使用其他不相关的印章。
• 盖章前应仔细核对付款单的内容，确保无误后再进行盖章，以避免因内容错误而导致的纠纷。
• 付款单盖章后应妥善保管，避免遗失或损坏，以备后续查询或作为法律证据使用。

综上所述，付款单公司负责人盖章是可以的，但需遵循上述具体要求和流程。如有进一步需要，您可以继续咨询我。